操作系统环境下可以运行的不是hex而是可执行文件，工程是可以有的。
如楼上所说，你需要考虑的是通讯怎么做。

我觉得不能啊，你至少用了两块单片机，它们必然是各自独立运行，你需要的是设计接口进行通讯，你这还是单向通讯，不过是识别目标，传输坐标。