[请教]单片机离线运行出错

单片机用的是atmega48pa,现在碰到的问题是：
    仿真器相连在线调试时结果一切正常，但是拔掉仿真器连线，或者连接完全掉电的仿
真器时总是报错误的结果。
    如果拔掉仿真器连线后用数据采集卡监测电路板中的信号却一切正常。现在可以确定
的是拔掉仿真器连线后，单片机仍然在执行烧结进去的程序，但就不知是单片机采集信号
有误，还是单片机进行计算时出了问题，总之一拔掉仿真器连线，最后结果必错。

有哪位了解这是怎么回事吗，或者以前碰到过类似的问题？
在此先谢了！！！