首先，此类错误基本是被STM32芯片遇到，并且基本都是使用JLINK仿真器，其实我们以下的方法不一定可以帮你解决问题，问题真正的原因我们也没有在这个帖子公开、如果需要解决，请联系armjishu的JLINK仿真器工程师，他会帮助你解决的；生产的JLINK可以解决这个问题。
MDK中出现 Error: Flash download failed-"Cortex-M3"的原因及解决办法：
1.Jtag模式下，主要是芯片大小选错
出现这处问题通常是MDK中的Flash的编程算法没有配置或没有配置正确，
神舟系列用的是STM32芯片。
在主菜单中打开Flash->Configure Falsh Tools配置窗口，切换到“Utilities"页。
按“Setting"按钮进入“Flash download setup"配置窗口
然后一路按“OK”按钮退出配置窗口。
在“Flash download setup"配置窗口点击“Add”按钮进入“Add Flash Programming Algorlthm"窗口
在“Add Flash Programming Algorlthm"窗口，根据你实际使用的芯片选择，这里的神舟III号STM32开发板用的是STM32F103ZET6，应先择"STM32F10X 128kB Flash",选定编程算法后，按“Add”按钮。
2.如果是在SWD模式下，Debug菜单中，Reset菜单选项（Autodetect/HWreset/sysresetReq/Vectreset）默认是AutoDetect，改成SysResetReq即可。